레트로바이러스(Retroviruses)에 대해 이해하기!!

레트로바이러스(Retroviruses란 무엇일까?

 

 

지난 15년 동안 레트로바이러스 및 게놈과 단백질의 서열과 구조에 관한 엄청난 양의 데이터가 보였습니다. 이러한 데이터에 접근하고 장을 읽는 데 도움을 주기 위해 일반적으로 발생하는 레트로바이러스 목록, 바이러스, 유전자 및 단백질의 명명 및 분류를 결정하는 주요 정의 및 규칙, 및 게놈의 비코딩 영역, 및 독자가 레트로바이러스 단백질 및 핵산 구조에 접근하고 볼 수 있도록 돕는 정보. 또한 7개의 레트로바이러스 속 및 2개의 분류되지 않은 그룹 각으로부터의 대표적인 레트로바이러스 게놈의 구조 도를 제공합니다. 이지 도는 각 속의 바이러스 유전 적 구성을 설명하고 레트로바이러스에 의해 사용되는 다양한 유전자 발현 전략을 이해하기 위한 기초를 제공합니다. 각 지도는 새로 생성된 특정 핵산 데이터베이스 항목과 상관관계가 있어 해당 서열에 즉시 접근하고 조작할 수 있습니다.

 

 

 

레트로바이러스 분류법

 

오랜 전통에 따라 바이러스 발견자는 바이러스의 이름을 지정할 권리가 있습니다. 세포 유기체의 특정 이름과 달리 바이러스 명명법에 대한 단단하고 빠른 규칙은 없습니다. 그러나 시간이 지남에 따라 몇 가지 규칙이 개발되었습니다. 바이러스 의 이름에는 일반적으로 바이러스가 처음 분리된 동물과 구별되는 특성, 일반적으로 감염과 관련된 질병이 포함됩니다. 그러나 이름은 식별자이며 반드시 바이러스 의 속성을 설명하지는 않습니다. 따라서, 인간 거품 바이러스 (HFC)는 일반적으로 인간을 거의 감염시키지 않는 침팬지 바이러스인 것으로 생각된다 ; 그럼에도 이름은 변하지 않습니다. 마찬가지로 일부 조류 백혈병 바이러스 (AVL) 균주가 질병을 유발합니다. 백혈병 (백혈병) 이외의 다른 질환이지만, 유의하게 변경되지 않은 한 (예 : 종양 유전자 삽입) 여전히 이름을 유지합니다. 바이러스 이름은 분류를 정의하지 않습니다.

 

하지만 분류를 혼동해서는 안 된다. 예를 들어, 한 속에 속하는 바이러스에는 다른 속의 바이러스와 같거나 그와 관련된 이름을 부여해서는 안 됩니다. 예를 들어, AIDS를 유발하는 렌티 바이러스는 HTLV-1 및 HTLV-2와의 직접적인 관계를 암시하기 때문에 HTLV-III (인간 T 세포 백혈병 바이러스 III)으로 명명될 수 없습니다. 컨벤션에 따라, AIDS 바이러스는 HIV (human immunodeficiency virus )로 명명되었습니다. 바이러스는 사람의 이름을 따서 명명해서는 안 됩니다. 이것은 비교적 최근의 관행이며, 많은 오래된 판례가 있습니다 (예 : Rout sarcoma virus ). 모든 바이러스와 마찬가지로 레트로바이러스의 분류 체계는 국제 바이러스 분류 체계위원회 (INTV)의 소위원회에 의해 체계화됩니다.

 

레트로바이러스는 한 번에 세 가지 하위 가족 (Oncovirinae, Spumavirinae 및 Lentivirinae)로 나누어졌지만 이러한 분류학적 분류는 더는 사용되지 않습니다. 대신에, 레트로바이러스는 현재 7개의 속으로 분류되며, 2개의 그룹 (물고기 레트로바이러스 및 곤충의 내인성 바이러스의 집시 그룹)이 분류를 기다리고 있습니다. 분류는 주로 pol 유전자 내의 서열 유사성에 기초하지만, 추가 유전자의 존재 또는 부재를 포함하는 다른 상관 된 특징이 때때로 사용되기도 합니다. 바이러스 때문인 질병 유형과 같은 주요 생물학적 분열을 명심해야 합니다. 특정 숙주 종 또는 표적 세포 유형, 비리 온 형태 또는 단순 대 복잡한 생활양식에 대한 tropism은 retrovirus의 진화적 관계와 관련이 없으며 분류 학적 분류에 대한 적절한 근거가 아닙니다.

 

 

레트로바이러스 게놈의 구조적 및 유전적 특징

 

복제 가능한 레트로바이러스의 게놈 범위는 7 ~ 12kb입니다. 대표적인 레트로바이러스 게놈의 길이에 제공되어있습니다. 다음은 레트로바이러스 게놈의 RNA 및 DNA 형태에 대한 간략한 설명입니다. 합성, 구조 및 기능에 대한 자세한 설명은 이 책의 특정 장에서 확인할 수 있습니다.

 

 

 

복제 유능한 레트로바이러스  RNA의 영역과 특징

 

바이러스성 RNA 서브 유닛의 5 '말단에 있는 첫 번째 코딩된 뉴클레오타이드, 아마도 프로 바이러스 DNA의 RNA 전 시체에서 개시 뉴클레오타이드; 5'-5 '연결로 메틸화된 "뚜껑"리보 뉴클레오타이드에 연결됨.

 

R (반복)

RNA 전사 개시 및 폴리와 데 일화의 위치에 의해 경계가 정의되는 게놈 RNA의 양쪽 말단에서 반복되는 짧은 (15-250 뉴클레오타이드) 서열; 또한 각각 긴 말단 반복 (LTD)에서 U3와 U5 사이에 존재하는 바이러스성 DNA에 2회 존재한다. 레트로바이러스의 대부분에서, R은 폴리와 데 닐화 신호 서열 (AAUAAA)을 함유한다.

 

TAR (Tat-responsive)

영장류 렌티 바이러스에서, Tat 트랜스- 활성화제의 결합 부위로서 작용하는 고도로 구조화된 R 영역.

 

U5 (고유 5 ′)

R과 프라이머 결합 부위 (PBS) 사이에 있는 서열 (70-250 뉴클레오타이드). U5는 LTD의 일부로서 게놈 RNA에 1회, 바이러스 DNA에 2회 존재한다.

 

PBS (프라이머 바인딩 사이트)

U5에 인접하고 특정 숙주 TRAN 종의 3 '말단에 상보적인 영역 (보통 18개의 뉴클레오타이드 길이 및 시작 5'TGF). PBS는 바이러스 DNA의 마이너스 (-) 가닥의 합성을 개시하기 위한 역전사 효소의 프라이머로서 기능하는 TRAN의 결합 부위이다.

 

개그

알려진 모든 복제 가능한 레트로바이러스의 게놈에서 발견되는 4개의 코딩 도메인 중 첫 번째; 절단 생성물이 바이러스 코어의 주요 구조 단백질 (매트릭스 [MA], 뚜껑시드 [CA] 및 뉴 클레오 뚜껑시드 [NC]) 인 폴리 단백질 (Gag)을 암호화한다 . 스 푸마 바이러스는 이 일반적인 규칙의 예외입니다 : 그들의 개그 단백질은 광범위하게 절단되지 않습니다.

 

찬성

절단 산물에는 항상 프로테아제 (PR) 및 때로는 dUTPase (DU)가 포함된 다 단백질 (Gag-Pro 또는 Gag-Pro-Pol)의 일부를 인코딩하는 모든 알려진 복제 가능 레트로바이러스의 게놈에서 발견되는 4개의 코딩 도메인 중 두 번째 B형 및 D형 바이러스).

 

폴

절단 단백질에는 항상 역전사 효소 (RT)와 인테크라 제 (IN), 일부 렌티 바이러스에서는 dUTPase가 포함된 다 단백질 (Gag-Pro-Pol)의 일부를 코딩하는 모든 알려진 복제 가능 게놈에서 발견되는 4개의 코딩 도메인 중 3번째 DU). 스 푸마 바이러스에서, pol은 스 플라이 시 된 MRSA를 통해 Pol-Pol 폴리 단백질으로서 발현된다.

 

env

절단 산물 US (표면) 및 TM (막 통과)이 바이러스 외피의 구조 단백질인 폴리 단백질 (Env)을 암호화하는, 모든 공지 된 복제 가능한 레트로바이러스의 게놈에서 발견 한 4개의 코딩 도메인 중 마지막.

 

SD (스플라이스 도나 사이트) 바이러스 RNA의 상류 (5 ') 부분이 (스플라이스 수용체, SA에서) 바이러스 RNA의 하류 (3') 부분에 결합하여 스 플라이 시 된 서브 게놈 MRSA를 형성하는 부위 (또는 부위). "5 '접합 부위"는 세포 RNA에 대해 일반적으로 사용되는 용어가 되었지만, 일부 바이러스에서 이들 부위의 복잡한 배열 때문에 레트로바이러스에는 권장되지 않습니다.

 

SA (Splice Acceptor Site)

바이러스 RNA의 다운 경향 (3 ') 부분이 (스플라이스 공여자, SD에서) 업경향 (5') 부분에 결합하여 스 플라이 시 된 서브 게놈 MRSA를 형성하는 사이트 (또는 사이트).

 

이상 레트로바이러스에 대해 알아보았습니다. 감사합니다.