인간 헤르페스 바이러스 : 알파 헤르페스 바이러스 게놈의 유전자 비교

인간 헤르페스 바이러스에 대해 알아보자!!

 

 

인간 헤르페스 바이러스 1, 2 및 3 (단순 포진 바이러스 1 (HAS-1), 단순 포진 바이러스 2 (HAS-2) 및 수두 대상 포진 바이러스 (VCV))은 원래 생물학적 특성에 따라 알파 헤르페스 바이러스로 분류됩니다. 그리고 이후에 각각의 게놈의 서열에 관한 것입니다. 이들 바이러스는 모두 감각 신경절에서 잠복 감염을 유지하고, 점막 및 피부의 살아있는 세포를 포함하여 다양한 인간 세포를 생산적으로 감염시킬 수 있습니다. 이러한 상피 부위는 또한 바이러스 가 다른 개인을 감염시킬 수 있는 출구 지점을 제공합니다. 인간을 감염시키는 알파 헤르페스 바이러스의 게놈 구조는 언뜻 보기에 상당히 유사합니다. 모두 길이가 다른 반복으로 두 개의 고유한 구분이 있습니다. 고유 구분은 짧게 (S) 및 길게 (L)로 지정되고 반복은 내부 (IR) 또는 터미널 (TR)로 지정됩니다.

 

단순 렉스 바이러스 속 (HAS-1 및 HAS-2)의 구성원은 4개의 대략 등물 이성질체로서 존재하며, 각각의 이성질체는 길고 짧은 성분의 상대적인 배향이 다르다. HAS 이성질체 중 하나의 방향은 원형으로 지정되어 있으므로 TRI-U L -IRA-IRS-U S로 지정할 수 있습니다-TRS. VCV는 또한 4개의 게놈 이성질체를 생산하지만, 긴 성분이 거꾸로 되는 것은 전체 게놈의 약 5%로 빈도가 상당히 감소합니다. 이것은 인간 알파 헤르페스 바이러스 (6000-7400bp)에서 반복되는 U S 및 HAS-1 및 HAS-에서 U L의 반복되는 반복과 비교하여 VCV 긴 성분 (88.5bp)을 반복하는 짧은 반복의 결과라고 추측하고 있습니다. (약 9,000bp) 더 짧은 반복 영역은 상동 재조합 이벤트의 빈도를 감소시켜 VCV 게놈에서 긴 성분의 빈번한 반전을 초래할 것으로 예상합니다.

 

129 KBC VCV 게놈은 인간 헤르페스 바이러스의 가장 작은 게놈인 반면, HAS-1 및 HAS-2 게놈은 길이가 152 KBC를 초과합니다. 인간 단순 렉스 바이러스의 G + C 함량은 약 68% 인 반면, VCV 게놈은 단지 46% G + C이다. 따라서 두 계통이 공통의 선조에서 발생하기 때문에 상당한 수의 돌연변이가 발생하였습니다. 세 바이러스 모두 용해 복제 (oriLyt) 및 게놈 절단 및 패키징을 안내하는 잘 보존된 서열을 암호화합니다. oriLyt의 사본은 세 가지 바이러스 모두의 IRS 및 TRS에 있으며 HAS-1 및 HAS-2의 경우 L 중심 근처에 있습니다.

 

 

 

 

HAS 게놈에 없는 VCV 유전자

 

가장 긴 성분 유전자의 상동기관이 HAS-1, HAS-2 및 VCV에 존재하지만, 주목할만한 예외가 있다. 여섯 VCV U의 L의 유전자는 HAS U에는 상동이 없다. L(ORF1, ORF2, ORF13, ORF32, ORF57 및 ORF S / L)를. 이들 유전자 모두는 적어도 일부 세포 유형에서 세포 배양물에서의 복제에 필수적이다. ORF1은 대략의 세포막 단백질을 코딩하는 M의 R C- 말단 소수성 도메인 (17) 000. 그것의 기능은 알려지지 않지만, meow 세포에서 바이러스의 성장을 위해 반드시 필요하다, 말 헤르페스 바이러스 1 (EHV-1) 및 EHV-4 속의 구성원 모두 Varicellovirus 사과에 Alphaherpesvirinae, 이들 바이러스는 VCV ORF1에 상응하는 위치에서 유전자 (EHV 유전자 2로 지칭 됨)를 암호화하지만, VCV 대응물과 명백한 유사성은 없다.

 

VCV ORF2는 또한 세포 배양에서의 성장 밑면 쥐의 등 근 신경절에서의 지연의 확립에 필수적인 인산화 된 막-관련 단백질을 암호화한다, VCV ORF2와 매우 제한된 상 동성을 갖는 유전자는 EHV-1 및 EHV-4의 유전자 3을 포함하는 다른 바리 셀로 바이러스에 존재한다. 이들 유전자의 기능은 알려지지 않다. VCV ORF13은 팀이 지연 트 합성 효소를 암호화한다. 흥미롭게도, 동종 체는 다른 알파 헤르페스 바이러스에는 존재하지 않지만, 인간 헤르페스 바이러스 8, 헤르페스 바이러스 사이 미리, 헤르페스 바이러스 아 델레스 및 말 헤르페스 바이러스 2를 포함한 여러 감마 헤르페스 바이러스의 게놈에는 기능적 동족체가 들어 있습니다. 더욱이, 인간사이토 메가로 바이러스는 세포 팀이 된 신체 타제를 상향 조절한다.

 

따라서 바이러스 게놈 내로의 혼입, 또는 숙주 세포에서 팀이 지연 트 합성 효소의 다른 상향 조절 수단은 이들 바이러스에 대해 선택적 이점을 제공할 가능성이 있으며, 이는 아마도 전지 세포에서 바이러스 DNA 복제를 위한 새클레오타이드의 이용 가능성을 촉진하기 때문이다. VCV ORF13에 해당하는 영역 내에서 HAS-1 및 HAS-2는 U L을 인코딩합니다. 45는 반대 가닥에 인코딩되며 VCV에는 상 동성이 없습니다. U L45 유전자는 세포 배양에서 복제에 필수적인 타입 Ⅱ 막 단백질을 암호화한다.

 

 

바이러스에 고유한 L 성분 유전자

 

248 전기 ORF P는 U L (TRI 및 IRA)과의 경계에 반복적으로 존재한다. 관련 전 시체는 γ1, 34.5를 암호화하는 RL1 유전자에 대해 안티센스이고, 전장 대기 시간 관련 전 사체 (LAT)가 종결되는 시점에서 종료된다. 유전자는 주로 초기 또는 알파 클래스의 유전자를 포함하여 다른 HAS 유전자가 발현되지 않는 조건으로 주로 발현된다. ORF P 프로모터에서 ICP4 결합 부위의 결실은 발현을 증가시켜, ICP4가 정상적으로 ORF P를 억제하는 작용을 한다는 것을 시사한다. HAS 알파 유전자는 잠복 감염 동안 발현되지 않기 때문에, ORF P가 장복 적으로 감염된 새런에서 먼저 발현 될 수 있는 것으로 추측되었지만, 이는 입증되지 않았다. ORF P의 예측 된 HAS-2 대응물은 길이가 130개의 아미노산이고 처음 49개의 코돈에 대해 실질적으로 유사성을 가지며,

 

그 후 유사성은 HAS-2 RL1의 인트론에 상응하는 부위에서 현저하게 떨어져서, 반대 가닥, ORF P에 대응하는 HAS-2가 발현되는지는 결정되지 않았다. HAS-1의 ORF O는 ORF P보다 짧고, 그 안에 완전히 함유되어있다. 단백질은 ORF P와 유사한 방식으로 조절되고, 같은 개시 코돈으로부터 번역된 것으로 보이지만, 코돈 후 미지의 메커니즘에 의해 프레임을 이동시킨다. 35개를 다른 판독 프레임으로 옮겨서 2,000개의 명백한 M r 단백질의 번역을 초래 하였다.

 

단백질은 ICP4와 상호 작용하여 후자가 DNA에 결합하는 것을 막을 수 있다. ORF P와 유사하게, HAS-2 대응물에 대한 상동 성은 극단적인 N- 말단에서만 설득력이 있으며 HAS-2 단백질이 발현되는지는 알려지지 않다. γ 1, 34.5 단백질은 반복 영역에서 RL1에 의해 암호화되며, 프로모터는 서열에 있고 오픈 선도하는 프레임은 b 서열에 있다. 단백질은 신경 독성의 주요 결정 인자이며, 신장 개시 인자 알파를 탈인산화하여 바이러스 단백질의 번역을 보존하기 위해 포스파타아제 알파의 모집을 포함하여 다수의 흥미로운 기능을 가진다. HAS-2 대응물에는 인트론이 포함되어 있지만 보존되어 있습니다. VCV 또는 헤르페스 B 바이러스에는 명백한 동족체가 없다.